Fundado en 1979 en la Costa de Oaxaca, en 1986 se trasladó a su sede actual en la ciudad de Oaxaca. El CRUS cuenta además con dos predios, “ Las Trancas”, de 96 hectáreas, en el municipio de notepa Nacional en la Costa Oaxaqueña y “La Catalina”, de ocho hectáreas, en el municipio de Tlacamana, en el que se localiza el Centro de Aprendizaje de Tecnologías Apropiadas (CATA).