En los sistemas de producción actuales, los costos de la alimentación representan más del 50% de los costos de producción de carne, leche y huevo. Además, la disponibilidad de recursos para la alimentación animal es cada vez menor que la demanda de satisfactores para la humanidad, debido a su alta tasa de crecimiento e incremento de su poder adquisitivo. Asimismo, la pobreza de la población humana en el sector rural aumenta rápidamente, generando mayor presión sobre los recursos naturales y el deterioro consecuente de los mismos. El desvío de cereales y otros cultivos hacia la producción de biocombustibles está generando una competencia desleal para la alimentación animal y humana. La aglutinación de los sistemas de producción animal cerca de los centros de producción de insumos o de los mercados, genera cantidades elevadas de desechos que contaminan aguas, suelo y aire. Con base en lo anterior, es urgente mejorar la eficiencia de los sistemas de producción de satisfactores de origen animal y conservar el ambiente.
El concepto de calidad de los productos pecuarios ha variado a través del tiempo, además de ser distinto para cada eslabón de la cadena productiva. Por ejemplo, el ganadero piensa que produce el mejor ganado, independientemente de su tipo racial y sistema de producción; el comercializador busca el ganado que le dé el mayor rendimiento en canal y sin fundamento científico da preferencia a ciertas características de la canal con el fin de sacar el mayor provecho posible; los expendedores y fundamentalmente las tiendas de autoservicio, buscan productos con buena aceptación por el público pero a la vez que tengan una mayor vida de anaquel; por último pero no menos importante está el consumidor final que demanda productos que cumplan con sus expectativas organolépticas (agradable a los sentidos), a un costo bajo, que sean inocuos (no le causen daño a la salud) y mejor si son nutracéuticos (que ayudan a conservar la salud o a recuperarla), pero además están más conscientes de la importancia de que los productos provengan de unidades donde se haya cuidado el bienestar animal.

Desde 2000, un grupo de investigadores de la Universidad Autónoma Chapingo estableció convenios de colaboración con las Asociaciones Nacionales de Criadores de Ganado de Registro Tropicarne, Suizo, Jersey, Angus, Droughmaster, Santa Gertrudis, Braford y caprinos, con el propósito de evaluar la calidad genética de sus animales, realizar investigación aplicada, y capacitar a criadores y técnicos en el uso de los resultados de las evaluaciones genéticas. De 2001 a 2008 se realizaron evaluaciones genéticas y se publicaron resúmenes para Tropicarne (Núñez et al., 2002; 2003), Angus (Ramírez et al., 2004; 2007; 2008), Jersey (Núñez et al., 2004; 2005; 2008), Suizo Europeo (Núñez et al., 2003; 2004; 2005; 2006) y Suizo Americano (Núñez et al., 2004; 2005; 2006); además de impartir talleres de capacitación, así como la asesoría técnica para la evaluación genética de ganado Brahman de Costa Rica.
Uno de los grandes retos que el mundo tendrá que enfrentar en las próximas décadas es la de preservar los recursos naturales y al mismo tiempo producir alimentos en suficiencia para satisfacer las demandas de una población humana en crecimiento; que de acuerdo con las estimaciones realizadas, ésta se incrementará hasta ocho mil millones para el año 2020. De acuerdo con el Internacional Food Policy Research Institute la demanda actual de cereales es de 1.7 billones de toneladas y carne de 206 millones de toneladas, ésta podría incrementarse para el año 2020 en promedio, a 2.7 billones de toneladas de cereales y al menos a 290 millones de toneladas de carne.
La investigación en sistemas pecuarios sustentables se ha enfocado en tres aspectos: social, económico y ecológico. Los análisis sobre desarrollo sustentable son diversos debido la complejidad del tema y la variedad de indicadores involucrados (Brunet et al., 2005). En el aspecto social lo más preocupante es el abandono de la actividad agropecuaria por muchos productores (Cervantes et al., 2007); en el aspecto económico, la preocupación se ha centrado en la reducción de los costos de alimentación (Améndola, 2002); en el aspecto ecológico se han estudiado el abatimiento de los mantos freáticos y la consecuente necesidad de aumentar la eficiencia en el uso del agua (Godoy-Avila et al., 2003), y la emisión de residuos contaminantes al agua (Cach, 2008).
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En el Posgrado en Producción Animal se ha venido trabajando desde hace años en las áreas de curvas de producción y crecimiento, sistemas de información para el manejo integral de agroempresas y en estimación de niveles óptimos de nutrimentos e ingredientes en dietas para especies domésticas. Por esta razón en este documento se abordarán en este orden dichas sublíneas de investigación.
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